1921年9月3日，孙中山为援桂凯旋、准备北伐的将领举行宴会，发表演说，指出统一中国非出兵北伐不可。次月即乘军舰出巡广西，准备取道湖南北伐。北伐军三万在当天开拔。

到梧州后，电召广东省长、总司令陈炯明来梧州商谈北伐问题，后于11月8日在梧州与陈炯明会晤，与陈炯明讨论了北伐的事宜，要求陈炯明抽调40个营参加北伐，由广东承担饷械的任务。11月上、中旬，在梧州国民党员会上发表演讲，批判“革命军起，革命党消”的理论，要求大家反向“革命军起，革命党成”方向去努力。

在北伐军至桂林后，孙中山在桂林设立了北伐军大本营，进行了整军，将驻桂的粤、滇、黔、赣4省军队编为7个军，进行三民主义思想教育，加强军事训练。到1922年初北伐军大体整编完毕，待命出发。